Una nueva empresa de biotecnología ha surgido del Instituto de Diseño de Proteínas de la Universidad de Washington con $ 6 millones en fondos y un equipo de liderazgo recién llegado de Neoleukin Therapeutics, otra empresa derivada de IPD.
Monod Bio está desarrollando biosensores que pueden detectar rápidamente proteínas virales, toxinas, anticuerpos u otras moléculas. Los sensores están construidos a partir de proteínas diseñadas desarrolladas en el IPD. Cuando el sensor reconoce su objetivo, emite luz.
Los sensores están diseñados con software IPD que puede diseñar proteínas desde cero, «de novo», en lugar de a partir del número más limitado de diseños que se encuentran en la naturaleza.
«Somos la primera empresa, hasta donde sabemos, que utiliza diseño de proteínas computacionales de novo para biosensores y diagnósticos», dijo el director científico Alfredo Quijano Rubio en una entrevista con GeekWire. Los sensores funcionan en tubos de ensayo y uno de los siguientes pasos de la compañía es hacerlos más fáciles de usar, similar a las pruebas de embarazo caseras.
Quijano Rubio diseñó sensores para reconocer una variedad de objetivos mientras trabajaba en el laboratorio del director del IPD, David Baker, donde fue estudiante de posgrado hasta esta primavera.
En un estudio en Naturaleza En enero de este año, Quijano Rubio, Baker y sus colegas mostraron sensores que reconocen la proteína «pico» del virus COVID-19, así como los anticuerpos contra ella. Otros sensores reconocieron la toxina del botulismo, el receptor HER2 relacionado con el cáncer, y la troponina cardíaca, que el cuerpo libera después de un ataque cardíaco.
“La consecuencia de esto es que ahora puede llevar biosensores a lugares donde generalmente no los tiene, como dispositivos portátiles o puntos de atención”, dijo el director ejecutivo de Monod, Daniel-Adriano Silva.
La troponina, por ejemplo, generalmente se mide en el hospital para ayudar a evaluar si alguien ha tenido un ataque cardíaco. En cambio, Silva imagina probar a alguien en la ambulancia camino al hospital.
Silva dejó su trabajo esta primavera como jefe de investigación en Neoleukin, que está desarrollando tratamientos para el cáncer y COVID-19, para explorar la posibilidad de iniciar una nueva empresa. «Empecé a volver para hablar con David, para ver cuál era la próxima tecnología», dijo.
No tuvo que mirar muy lejos. Quijano Rubio también es cofundador de Neoleukin. David Shoultz, ex director del programa COVID-19 de Neoleukin, fue nombrado director de operaciones y cofundador.
Otros cofundadores de Monod incluyen al director de IPD Baker, el científico de IPD Andy (Hsien Wei) Yeh y Dave Johnson, ex CEO de VelosBio, que fue adquirida por Merck por $ 2,750 millones el año pasado.
El equipo ha estado operando desde noviembre desde CoMotion Labs en el campus de la Universidad de Washington. En diciembre, la startup completó su ronda inicial de $ 6 millones de amigos y familiares.
Seattle está salpicada de nuevas empresas de IPD. Cyrus Biotechnology, por ejemplo, recientemente recaudó $ 18 millones y tiene más de 90 asociaciones con compañías farmacéuticas, A-Alpha Bio ha recaudado $ 20 millones e Icosavax se hizo pública este año con un aumento de $ 180 millones para promover sus vacunas para COVID-19 y otras afecciones. .
Los investigadores de IPD también ganaron el premio «Avance del año» de la revista Science este diciembre por su software impulsado por IA para predecir cómo se pliegan las proteínas. Los sensores de Monod están diseñados con un software de ingeniería de proteínas desarrollado anteriormente en IPD, llamado Rosetta.
El equipo de Monod utilizará los fondos para madurar y expandir su plataforma, generar nuevos biosensores para objetivos adicionales en biotecnología y salud, y construir prototipos para detectar objetivos en aplicaciones del mundo real.
Los investigadores de IPD también han construido sensores para detectar un conjunto de anticuerpos COVID-19, con el objetivo de determinar el nivel de protección inmune de anticuerpos de una persona. Mostraron estos sensores en una preimpresión reciente.
Los sensores de Monod se basan en dos componentes. Un componente es una proteína que reconoce un objetivo. Tras el reconocimiento de la diana, la proteína cambia de un estado cerrado a uno abierto. En su estado abierto, la proteína puede unirse al segundo componente del sensor. Cuando los dos se unen, el sensor se enciende. La luz es emitida por luciferasa, una enzima emisora de luz.
La región que reconoce el objetivo se puede cambiar por otra. “Alfredo descubrió una manera de hacer esto de una manera modular”, dijo Silva.
Al unirse al objetivo, el sensor se desplaza de una manera que se propaga a través de la proteína para abrir su forma. Tal efecto, en el que una acción en una parte de una proteína se transmite a otra, se llama alosterio y se usa para regular la actividad de muchas de las proteínas del cuerpo. Allostery fue descubierto en la década de 1960 por el bioquímico ganador del premio Nobel Jacques Monod y sus colegas.
Monod ahora está contratando bioquímicos e ingenieros de proteínas. El equipo está buscando su propio espacio en el estrecho mercado de laboratorios de Seattle y apunta a crecer a alrededor de 15 o 20 empleados para fines de 2022.
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