El Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson de Seattle ha contratado a un nuevo vicepresidente y director de datos: el bioestadístico y educador en ciencia de datos Jeffrey Leek. Leek comenzará en el puesto recién formado el 1 de julio, anunció Hutch el martes.
Leek dejará su puesto actual como profesor de bioestadística y oncología en la Escuela de Salud Pública Johns Hopkins Bloomberg y codirector de su Laboratorio de Ciencia de Datos.
Desarrolla herramientas para ayudar a comprender datos genómicos y biomédicos a gran escala y ha ayudado a generar programas de aprendizaje en línea que han inscrito a más de 8 millones de personas. También dirige Data Trail, que capacita y apoya a las comunidades desatendidas para trabajar en ciencia de datos, y en 2020 cofundó la empresa emergente de gestión de datos Streamline Data Science.
Leek llegará a Hutch cuando la institución elabore una nueva estructura de asociación propuesta con UW Medicine, Seattle Children’s y Seattle Cancer Care Alliance, y dará forma a una empresa de datos integrados.
Su movimiento es, en cierto modo, un regreso a casa: el nativo de Idaho obtuvo su Ph.D. en la Universidad de Washington y ha mantenido relaciones con investigadores regionales. También se unirá a la facultad de Fred Hutch como profesor en la división de ciencias de la salud pública.
Hablamos con Leek sobre sus planes en Fred Hutch, cómo ve la institución integrándose en la comunidad tecnológica y empresarial, y sus planes para expandir la educación en ciencia de datos. La siguiente entrevista ha sido editada por motivos de brevedad y claridad.
GeekWire: Felicidades por el nuevo concierto, Jeffrey. ¿Qué es lo que más te emociona?
Jeffrey Puerro: Estoy entusiasmado con la posibilidad de construir un ecosistema de datos a escala institucional. He estado al frente del Laboratorio de ciencia de datos de Johns Hopkins aquí durante los últimos años, y realizamos una gran cantidad de capacitación en desarrollo de infraestructura y administración de datos, cursos masivos abiertos en línea en Coursera. Esta oportunidad es tomar ese pensamiento y escalarlo al nivel de una institución y encontrar una manera de ayudar a todos en Hutch a usar los datos de manera más eficiente, fácil y divertida. Los investigadores allí son de clase mundial y es divertido imaginar las nuevas colaboraciones que vamos a construir. Ser parte del gran ecosistema de datos y tecnología de Seattle también es increíblemente convincente.
GeekWire: ¿Qué implica hacer un ecosistema de datos?
Puerro: Se trata de configurar las tecnologías correctas, facilitar el uso de los datos, incorporar las preocupaciones éticas y de privacidad correctas y luego capacitar a las personas para que usen los datos de maneras que tal vez no hayan podido antes. Y así, todo eso en conjunto crea un entorno en el que puede acelerar un montón de diferentes tipos de investigación, desde la investigación del cáncer hasta las enfermedades infecciosas y todo en todos los ámbitos.
GeekWire: ¿Cuáles son las oportunidades de reunir datos de las instituciones de investigación del área de Seattle?
Puerro: Los datos que se recopilan sobre todos los diferentes tratamientos y protocolos en estas instituciones se pueden reunir de una manera que nos permita realizar análisis a gran escala, para identificar qué terapias funcionan dentro de qué subpoblaciones e identificar hipótesis para el seguimiento con futuras investigar. La verdadera emoción en torno a esto es poder aprovechar los datos de esas instituciones para responder algunas de las preguntas que son realmente difíciles de responder a escala de una sola institución. Cuando tienes un evento raro o un efecto secundario, es más difícil verlo.
GeekWire: ¿Cómo ve a Fred Hutch integrándose en la comunidad tecnológica y empresarial más grande?
Puerro: The Hutch realmente está pensando dónde están los puntos para una relación mutuamente beneficiosa entre la institución y los socios privados, ya sea que los inversores ayuden a respaldar ideas centradas en la ciencia de datos o hablar con socios potenciales sobre la expansión del tamaño y el alcance de los análisis. que podemos hacer. Desea tener mucho cuidado para mantener la confianza de la empresa sin fines de lucro y, al mismo tiempo, encontrar formas de obtener lo mejor de la infraestructura privada para colaborar en la creación de mejores soluciones para los pacientes. Es algo complicado de navegar.
GeekWire: ¿Cómo ve a Hutch trabajando con jugadores más grandes como Amazon y Microsoft, en comparación con nuevas empresas más pequeñas?
Puerro: Seguro que hay diferencias y oportunidades. Con las empresas más grandes, mi experiencia ha sido, y lo que espero hacer, es comenzar con pequeños puntos de contacto. Entonces, encuentra un investigador que tiene una necesidad realmente seria, como escalar un tablero con datos de enfermedades infecciosas a una gran comunidad, o tal vez tiene un socio tecnológico a gran escala que ya tiene tecnologías existentes. Y luego, una vez que haya construido esa primera relación, puede escalar desde allí para identificar otros lugares en los que puede crecer. Descubrí que lo que realmente me gusta encender un fuego es identificar a las personas que están emocionadas por un problema común y hacer que trabajen juntas y construyan una solución para él. Y luego verter el apoyo institucional detrás de esto realmente puede explotar ideas geniales en el público.
GeekWire: ¿Puede ampliar el papel de Hutch en la asociación o el fomento de nuevas empresas?
Puerro: Hay de todo, desde licencias de tecnologías hasta la identificación de formas de apoyar a los aprendices que se ven a sí mismos creciendo y convirtiéndose en una comunidad más parecida a una startup en lugar de dedicarse a la academia. ¿Cómo creamos esa infraestructura de apoyo, para que la gente con ese tipo de pasión pueda hacerlo? Se trata de construir relaciones entre personas que quieren resolver problemas similares. Creo que hay mucho espacio para la creatividad, especialmente en el espacio de datos, aprendizaje automático e inteligencia artificial en la interfaz entre la biotecnología y la ciencia de datos.
GeekWire: Cuéntenos más sobre sus esfuerzos de divulgación con Data Trail y cómo cree que encajará en su trabajo en Seattle.
Puerro: Las personas que toman cursos masivos abiertos en línea ya están bien educados, como las personas con nivel de maestría que intentan cambiar de carrera. Y entonces comenzamos a concebir cómo podríamos construir un programa que atraería a personas de la comunidad a la empresa de datos en Hopkins. Creamos un programa de capacitación diseñado para la ciencia de datos básica y la gestión de datos y nos asociamos con organizaciones comunitarias sin fines de lucro para identificar estudiantes talentosos en matemáticas y ciencias en nuestro vecindario. Los sometimos a un programa de tutoría en el que les pagaríamos para completar los cursos, les proporcionamos computadoras portátiles y trabajamos con socios sin fines de lucro para brindar apoyo social y financiero. Trabajamos con Johns Hopkins para que pudieran ingresar como administradores de datos y ciencia de datos de nivel de entrada, y creamos este camino hacia el ecosistema de Johns Hopkins. Estoy muy emocionado de que Data Trail en Seattle comience a crecer. Esperamos ejecutarlo en otros lugares del país también.
GeekWire: ¿Pensamientos finales?
Puerro: Una de las cosas que realmente me encantaría hacer en términos del ecosistema tecnológico es comenzar a establecer conexiones con personas apasionadas por la investigación del cáncer y la capacitación en ciencia de datos de código abierto, cualquiera de las cosas de las que he hablado en el ecosistema. Espero ser un participante activo en ese sistema y la gente allí. Espero que la gente de ese lado se comunique conmigo si están entusiasmados con trabajar con nosotros, y planeo comunicarme también en la otra dirección.
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